库区天然生态渔场鱼产量要达到3万吨产量，需要大规格鱼种1亿尾。目前库区大规格鱼种生产能力很低，在维持现有养殖生产条件下，自给率仅达到40%左右。苗种的需求量缺口巨大。实施苗种繁育体系规划，到2015年各种规格苗种供应能力将达到3亿尾，苗种需求基本自给。

　　水产原良种场规划

　　规划在长寿、奉节、忠县、开县建设四大家鱼原良种场4个；在巴南建设长薄鳅原良种场1个；在涪陵建设长吻鮠原良种场1个；在丰都建设黄颡鱼原良种场1个；万州建设岩原鲤原良种场1个；渝北建设中华倒刺鲃原良种场1个；云阳建设细鳞斜颌鲴原良种场1个；石柱建设大鳍鳠原良种场1个；江津建设翘嘴鲌原良种场1个；巫山建设厚颌鲂原良种场1个；武隆建设裂腹鱼原良种场1个；开县建设胭脂鱼原良种场1个，共计15个。重点为增殖放流提供苗种服务。

　　繁殖亲本换代规划

　　生产放流苗种的鱼种场站亲本改良换代，是保证苗种质量的重要措施。

　　规划对巫山、巫溪、奉节、云阳、万州、开县、忠县、丰都、石柱、涪陵、武隆、长寿、渝北、巴南、北碚、江北、南岸、沙坪坝、大渡口、九龙坡、江津21个县（区）等45个重点水产苗种场及规划的15个原良种场（运行一定时期后）的各种鱼类原种亲本进行更换。